«Полевой госпиталь Синдзюку» расскажет о квартале Кабуки-тё района Синдзюку, в префектуре Токио, который полон баров, кинотеатров, манга-кафе, а также хост-клубов и лав-отелей, где есть старая, но особенная больница. Из-за того, что она расположена в центре развлекательного района в больницу приходят люди, отличные от среднестатистического японца: бездомные, иностранцы, хосты, хозяева борделей и секс-работники. Однажды в больнице появляется загадочная женщина по имени Йоко Ниси Фриман (Койкэ Эйко). Она врач с гражданством США и военным медицинским опытом. Такамине Тору (Накано Тайга) - племянник хозяина больницы. Он косметолог-дерматолог, но изучает анестезию в больнице своего дяди. Тору мечтает перестроить больницу и открыть на её основе клинку косметической хирургии, но после встречи с Йоко, его жизнь меняется.